Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a3Q9JHW9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a3Q9JHW9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a3Q9JHW9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms