Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms