Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DysfQ9ESD7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms