Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp29Q9ES63 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp29Q9ES63 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms