Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lima1Q9ERG0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms