Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ndst3Q9EQH7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ndst3Q9EQH7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndst3Q9EQH7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms