Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms