Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SgshQ9EQ08 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms