Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms