Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xab2Q9DCD2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms