Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnk1dQ9DC28 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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