Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syde1Q9DBZ9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms