Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms