Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam216aQ9DB54 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms