Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph3bQ9DA80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms