Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd8Q9DA37 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms