Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmd12Q9D8W5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd12Q9D8W5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms