Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mrpl17Q9D8P4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mrpl17Q9D8P4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mrpl17Q9D8P4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mrpl17Q9D8P4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl17Q9D8P4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Mrpl17Q9D8P4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl17Q9D8P4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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