Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D8N1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms