Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn22Q9D7U6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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