Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tmem54Q9D7S1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem54Q9D7S1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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