Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9D7E4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms