Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Cldn23Q9D7D7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Cldn23Q9D7D7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cldn23Q9D7D7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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