Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nsmce1Q9D720 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce1Q9D720 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms