Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D454 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D454 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D454 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms