Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms