Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus10Q9D3U0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms