Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim42Q9D2H5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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