Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms