Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ist1Q9CX00 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ist1Q9CX00 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms