Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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