Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nicn1Q9CQM0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms