Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bhlhe41Q99PV5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms