Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1b4Q99ME6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms