Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tm2d1Q99MB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms