Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sh3bp5lQ99LH9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sh3bp5lQ99LH9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms