Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NgrnQ99KS2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NgrnQ99KS2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms