Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms