Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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