Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddb2Q99J79 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms