Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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