Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TardbpQ921F2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TardbpQ921F2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms