Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin3bQ91ZU9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms