Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
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Usb1Q91W78 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usb1Q91W78 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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