Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pth2Q91W27 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms