Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vps4aQ8VEJ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vps4aQ8VEJ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vps4aQ8VEJ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps4aQ8VEJ9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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