Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc115Q8VE99 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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