Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fyco1Q8VDC1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms