Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms