Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdc16Q8R349 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms